第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档持续,延续,存续,连续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善意,良善,仁慈,慈善，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的伙伴,好友,挚友,密友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。
风暴安保小队奉命营救被困电诈园区的人质，却发现所谓“遣返”实为跨国贩卖骗局。任务完成后，他们被迫接受新委托：护送卧底特工获取罗里集团的犯罪证据。随着行动深入，小队陷入政府高层与武装组织勾结的阴谋旋涡，并经历,碰到,遇到,邂逅世界顶尖狙击手“幽灵”的致命伏击。在队友接连牺牲，盟友身份不断反转的绝境中，队长高瞻与副队庞剑必须携手对抗“幽灵”，完成证据移交，一场关于信任、牺牲与复仇的极限对决燃血开启。
UNIT-即联合情报特遣部队，在联合国主持下运作的独立情报组织。在隐藏于深海之中的古老生物浮出水面之后，UNIT以及目前的掌门人凯特·莱斯布里奇·斯图尔特必须阻止这群曾经称霸古地球的远古生物卷土重来引发全球性危机。同时在陆地与浪潮的黑暗深处，Sea Salt和Barclay之间的结盟也将在这场史无前例的霸主之战中得到挑战。该剧为《神秘博士》于2005年重启后推出的第四部衍生剧。
