2019年，世界被人工智能Humagear统治，身处不同世界的假面骑士ZERO-ONE和假面骑士ZI-O奇迹般地相遇。虽然二人都是为了拯救世界，但等待着他们的究竟是携手还是对立？ 爸爸,父亲大人,爹爹,老父亲的梦想、孩子,男孩,少年,男童的梦想、各自的想法互相碰撞时，到底会面临怎样的未来…！？
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
